Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gsx1P31315 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gsx1P31315 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms