Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Hoxa10P31310 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa10P31310 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa10P31310 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms