Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxc10P31257 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxc10P31257 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxc10P31257 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms