Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Spi1P17433 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spi1P17433 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spi1P17433 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms