Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kcna3P16390 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kcna3P16390 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kcna3P16390 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms