Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RhoP15409 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RhoP15409 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhoP15409 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhoP15409 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhoP15409 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhoP15409 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RhoP15409 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhoP15409 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhoP15409 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhoP15409 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhoP15409 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhoP15409 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RhoP15409 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RhoP15409 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RhoP15409 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RhoP15409 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RhoP15409 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RhoP15409 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RhoP15409 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RhoP15409 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RhoP15409 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RhoP15409 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms