Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FlgP11088 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FlgP11088 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FlgP11088 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FlgP11088 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FlgP11088 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FlgP11088 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FlgP11088 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FlgP11088 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FlgP11088 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FlgP11088 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FlgP11088 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FlgP11088 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FlgP11088 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FlgP11088 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FlgP11088 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FlgP11088 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FlgP11088 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FlgP11088 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FlgP11088 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FlgP11088 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FlgP11088 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FlgP11088 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FlgP11088 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FlgP11088 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FlgP11088 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms