Protein–RNA interactions for Protein: P05524

Fgf3, Fibroblast growth factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf3P05524 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fgf3P05524 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fgf3P05524 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fgf3P05524 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms