Protein–RNA interactions for Protein: O88983

Stx8, Syntaxin-8, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx8O88983 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Stx8O88983 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Stx8O88983 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx8O88983 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms