Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdkO55028 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BckdkO55028 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BckdkO55028 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BckdkO55028 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms