Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem200cJ3QK46 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem200cJ3QK46 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms