Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn34c3J3QJW5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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