Protein–RNA interactions for Protein: J3JS27

Vmn1r194, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r194J3JS27 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r194J3JS27 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r194J3JS27 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms