Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm5218F6YH22 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm5218F6YH22 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms