Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna1iE9Q7P2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna1iE9Q7P2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1273.4 ms