Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Aldh3b2E9Q3E1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Aldh3b2E9Q3E1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms