Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Trappc8E9PWG2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Trappc8E9PWG2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Trappc8E9PWG2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms