Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc144bE9PVZ3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc144bE9PVZ3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc144bE9PVZ3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms