Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm4491E0CX42 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Gm4491E0CX42 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm4491E0CX42 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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