Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc78D3Z5T1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms