Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc13D3YV10 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc13D3YV10 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc13D3YV10 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms