Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930444P10RikD3YUR1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4930444P10RikD3YUR1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
4930444P10RikD3YUR1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms