Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Otud4B2RRE7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Otud4B2RRE7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Otud4B2RRE7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms