Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pm20d2A3KG59 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pm20d2A3KG59 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms