Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Knop1Q9Z2Q2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Knop1Q9Z2Q2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Knop1Q9Z2Q2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms