Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
Nup160Q9Z0W3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nup160Q9Z0W3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nup160Q9Z0W3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nup160Q9Z0W3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms