Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Plod3Q9R0E1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Plod3Q9R0E1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms