Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CtsfQ9R013 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CtsfQ9R013 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CtsfQ9R013 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms