Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SpastQ9QYY8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms