Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG1

Edf1, Endothelial differentiation-related factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edf1Q9JMG1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Edf1Q9JMG1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Edf1Q9JMG1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms