Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Extl1Q9JKV7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Extl1Q9JKV7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Extl1Q9JKV7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms