Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lmx1aQ9JKU8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lmx1aQ9JKU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lmx1aQ9JKU8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms