Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx20Q9JJY4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ddx20Q9JJY4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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