Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrlQ9JJU8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms