Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Bco1Q9JJS6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms