Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJK5

Herpud1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herpud1Q9JJK5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Herpud1Q9JJK5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Herpud1Q9JJK5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms