Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Slc12a4Q9JIS8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Slc12a4Q9JIS8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc12a4Q9JIS8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms