Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccl28Q9JIL2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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