Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LratQ9JI60 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LratQ9JI60 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LratQ9JI60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms