Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox9Q9EQM5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox9Q9EQM5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox9Q9EQM5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhox9Q9EQM5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rhox9Q9EQM5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rhox9Q9EQM5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 205.3 ms