Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tlr1Q9EPQ1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr1Q9EPQ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms