Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mlst8Q9DCJ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mlst8Q9DCJ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms