Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Swt1Q9DBQ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Swt1Q9DBQ9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Swt1Q9DBQ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms