Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim23Q9DAL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim23Q9DAL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms