Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Alkbh4Q9D8F1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alkbh4Q9D8F1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alkbh4Q9D8F1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms