Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Klhl40Q9D783 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Klhl40Q9D783 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl40Q9D783 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms