Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrp2bpQ9D4C6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms