Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Utp23Q9CX11 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Utp23Q9CX11 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms