Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CR55 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CR55 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9CR55 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Q9CR55 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Q9CR55 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CR55 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CR55 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9CR55 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CR55 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CR55 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms