Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem42Q9CR22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem42Q9CR22 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms